La SPEN, est dirigée par un Directeur Général qui la représente dans ses rapports avec les Tiers. Le Directeur Général est assisté par un Directeur Général Adjoint. Elle est organisée ainsi qu’il suit :
La Direction Générale (DG)
Les services rattachés à la Direction Générale sont :
- le Contrôle Général ;
- le Chargé de Mission ;
- le Service Logistique Environnement et Qualité ;
- les Secrétariats.
Les Directions opérationnelles sont :
1. La Direction des Ressources Humaines avec deux services, à savoir :
- le Service des Ressources Humaines et de la formation professionnelle ;
- le Service Administratif et informatique ;
- la Cellule Communication.
2. La Direction Comptable et Financière avec deux services, à savoir :
- le Service Comptabilité Générale et Analytique ;
- le Service Financier.
3. La Direction de la Planification et des investissements avec deux services, à savoir :
- le Service Etude et Planification ;
- le Service Travaux
4. La Direction du Patrimoine et du Contrôle de l'Exploitation avec trois services, à savoir :
- le Service Gestion du Patrimoine ;
- le Service Contrôle Administratif et Commercial;
- le Service Contrôle Technique et Qualité des Eaux
5. La Direction des marchés et des Achats avec deux services, à savoir :
- le Service des Marchés ;
- le service des Achats.